注册资本出资与出资制度的主要区别是特征不同、实践意义不同、类型不同。目前仍有27类制造业尚未实行注册资本认缴登记制度，仅再次实行注册资本认缴额审批制度。
详情如下：
1.特点不一样，不需要验证出资。公司股东对所认缴出资的资产具有消极的法律依据；出资制度必须注入验资报告，冻结开户银行资产，并证明自有资金；
2.实际意义不同。所认缴的出资额便于个体劳动者自主创业。公司无需全部注资即可注册运营。认缴出资制度必须由验资报告出资才能运作；
3.类型不一样。认缴出资企业是指风险不大的一般企业，认缴出资制企业涉及资产担保企业；
4.根据《中华共和国商业银行法》、《中华共和国保险法》、《中华共和国股份制银行管理办法》等法律法规和行政规章的现行标准以及国务院，办公厅的明文规定，目前仍有27类制造业，注册资本认缴登记制度尚未实施，但注册资本认缴额审批制度仅再次实施。